执行院长办公室

全面负责中山研究院日常工作，全面履行研究院行政负责人的各项职责。

党委书记办公室

全面履行党委书记的各项职责；集中精力抓好党的建设，负责党风廉政建设和师德师风建设工作；负责思想政治工作，负责研究院党员、干部、全体学生思想教育和日常管理工作；负责研究院维稳等工作。

学科副院长办公室

分管研究院研究生招生、教学、实践实习、就业、培训等研究生培养全链条管理工作。

科研副院长办公室

分管研究院科研管理、产业管理、国有资产管理、国际交流工作。

行政副院长办公室

分管研究院行政工作、后勤工作、安全工作。

领导小组办公室

研究院与中山市政府及火炬区管委会的交流协调工作。

院长助理办公室

兼任工会主席，协助执行院长开展工会管理工作。

综合管理部

协助主管院长开展行政办公室工作，同时兼顾校友联络工作。

研究生培养工作部

协助学科副院长主管招生、教学、实践实习、就业、培训等研究生培养管理工作。

科技产业发展部

协助科研副院长负责科研管理、产业管理、国际交流等工作。

国际事务部

协助科研副院长负责海外人才引进、国外合作项目、国际学术会议、外事活动组织等工作。

资产管理部

协助科研副院长负责国有资产购置、资产管理等工作。

学生工作部

协助党委书记负责研究生的管理工作。

财务部

协助执行院长主管研究院财务会计管理工作。

人力资源部

协助主管院长负责研究院人事、劳资、人才、组织及科级干部的管理等工作。

后勤管理部

协助主管院长开展基建、后勤工作，并承担研究院纪检监察工作。

光电产业促进会

为光电企业培养和提供人才，积极组织光电领域的学术交流，协调好光电企业与相关管理部门的关系，充分发挥行业联盟的引导作用，提供咨询服务。